Application of PolyPRep tools on HIV protease polyproteins using molecular docking

Abstract In recent years, the development of high-throughput technologies for obtaining sequence data leveraged the possibility of analysis of protein data in silico. However, when it comes to viral polyprotein interaction studies, there is a gap in the representation of those proteins, given their size and length. The prepare for studies using state-of-the-art techniques such as Machine Learning, a good representation of such proteins is a must. We present an alternative to this problem, implementing a fragmentation and modeling protocol to prepare those polyproteins in the form of peptide fragments. Such procedure is made by several scripts, implemented together on the workflow we call PolyPRep, a tool written in Python script and available in GitHub. This software is freely available only for noncommercial users.

Resumo Nos últimos anos, o desenvolvimento de tecnologias de alto rendimento para obtenção de dados sequenciais potencializou a possibilidade de análise de dados proteicos in silico. No entanto, quando se trata de estudos de interação de poliproteínas virais, existe uma lacuna na representação dessas proteínas, devido ao seu tamanho e comprimento. Para estudos utilizando técnicas de ponta como o Aprendizado de Máquina, uma boa representação dessas proteínas é imprescindível. Apresentamos uma alternativa para este problema, implementando um protocolo de fragmentação e modelagem para preparar essas poliproteínas na forma de fragmentos de peptídeos. Tal procedimento é feito por diversos scripts, implementados em conjunto no workflow que chamamos de PolyPRep, uma ferramenta escrita em script Python e disponível no GitHub. Este software está disponível gratuitamente apenas para usuários não comerciais.

Application of PolyPRep tools on HIV protease polyproteins using molecular docking / Aplicação da ferramenta PolyPRep em poliproteínas de protease de HIV usando docking molecular

Abstract In recent years, the development of high-throughput technologies for obtaining sequence data leveraged the possibility of analysis of protein data in silico. However, when it comes to viral polyprotein interaction studies, there is a gap in the representation of those proteins, given their size and length. The prepare for studies using state-of-the-art techniques such as Machine Learning, a good representation of such proteins is a must. We present an alternative to this problem, implementing a fragmentation and modeling protocol to prepare those polyproteins in the form of peptide fragments. Such procedure is made by several scripts, implemented together on the workflow we call PolyPRep, a tool written in Python script and available in GitHub. This software is freely available only for noncommercial users.

Resumo Nos últimos anos, o desenvolvimento de tecnologias de alto rendimento para obtenção de dados sequenciais potencializou a possibilidade de análise de dados proteicos in silico. No entanto, quando se trata de estudos de interação de poliproteínas virais, existe uma lacuna na representação dessas proteínas, devido ao seu tamanho e comprimento. Para estudos utilizando técnicas de ponta como o Aprendizado de Máquina, uma boa representação dessas proteínas é imprescindível. Apresentamos uma alternativa para este problema, implementando um protocolo de fragmentação e modelagem para preparar essas poliproteínas na forma de fragmentos de peptídeos. Tal procedimento é feito por diversos scripts, implementados em conjunto no workflow que chamamos de PolyPRep, uma ferramenta escrita em script Python e disponível no GitHub. Este software está disponível gratuitamente apenas para usuários não comerciais.

Endoparasites of marsupials in fragments of the Atlantic rainforest, western Paraná State, Brazil / Endoparasitas de marsupiais em fragmentos de Mata Atlântica no oeste do Estado do Paraná, Brasil

Abstract Knowledge of taxonomy and biodiversity of parasites is fundamental to better understand ecosystem dynamics. The objective of this study was to describe the helminth fauna of two species of marsupials in five fragments of the Atlantic rainforest in the western region of Paraná State, Brazil. In a total of 4050 trap-nights, the animals were captured using Sherman, Tomahawk, and Pitfall traps, euthanized, necropsied, and their organs inspected for helminths. After identification of the parasites, descriptors of infection, such as prevalence, mean abundance, mean intensity, and range of intensity, were calculated. Collectively, six helminth species were observed in 18 animals. The following five species were observed in Marmosa paraguayana: Viannaia hamata (58.8%), Gracilioxyuris agilisis (52.9%), Travassostrongylus sextus (17.6%), Oncicola luehei (5.9%), and Pritchardia boliviensis (5.9%). Whereas the following two species were observed in Monodelphis dimidiata: Trichohelix tuberculata (100%) and Travassostrongylus sextus (100%). This study represents a new locality record for all helminths described herein, and a new host for four helminth species. This is the first report on the helminth fauna of Monodelphis dimidiata, expanding knowledge about marsupials in the Brazilian Atlantic Forest.

Resumo Conhecimentos taxonômicos e da biodiversidade parasitária são fundamentais para uma melhor compreensão da dinâmica do ecossistema. O objetivo do estudo foi descrever a helmintofauna de marsupiais em cinco fragmentos de Mata Atlântica, na região Oeste do Estado do Paraná, Brasil. Em um total de 4.050 armadilhas/noite, os animais foram capturados com as do tipo Sherman, Tomahawk e Pitfall, eutanasiados, necropsiados e seus órgãos inspecionados em busca de helmintos. Após a identificação do parasita, foram calculados os indicadores de infecção (prevalência, abundância média, intensidade média e variação de intensidade). Seis espécies de helmintos foram observadas em dezoito animais; cinco em Marmosa paraguayana: Viannaia hamata (58,8%), Gracilioxyuris agilisis (52,9%), Travassostrongylus sextus (17,6%), Oncicola luehei (5,9%) e Pritchardia boliviensis (5,9%), e duas em Monodelphis dimidiata: Trichohelix tuberculata (100%) e Travassostrongylus sextus (100%). Este estudo representa um novo registro de localidade para todos os helmintos descritos e um novo hospedeiro para quatro deles. Trata-se do primeiro relato da helmintofauna de Monodelphis dimidiata, expandindo-se os conhecimentos sobre marsupiais na mata Atlântica brasileira.

Pequenos mamíferos como hospedeiros e reservatórios de Hantavírus em uma área periurbana de Mata Atlântica

Mammals play key roles in the dynamics of ecosystems, performing different ecosystem services. Among the forest mammals of neotropical regions, small mammals form one of the most diverse ecological groups. The landscape structure reflects on the displacement of individuals, changing the density of different populations of animals, influencing the transmission rate of pathogens between these animals, and also between humans. Small mammals are potential hosts and/or reservoirs of viruses that can cause zoonotic diseases. Among emerging zoonoses, in which the transmission cycle is related to these animals, hantaviruses are one of the most important. Literature data suggest that the viral detection rate in wild animals tends to be higher in degraded areas than in preserved areas. Data collected in a peri- urban area was compared with the scientific literature of similar analyses. Two field campaigns were carried out to capture small terrestrial mammals. For the detection of Hantavirus, oral and rectal swab samples were collected and analyzed from the captured specimens, and swab samples previously collected from chiroptera in the same location in 2021 were also analyzed. Of the 86 samples of small mammals analyzed by qPCR and by conventional PCR, all were negative for Hantavirus. The non-detection of Hantavirus in the small mammals sampled at the study site does not exclude the possibility of the presence of this virus in these animals in the sampled area and also in the region where this area is located, since this virus has already been found in nearby regions. It was not possible to verify if the hypothesis, that the incidence of Hantavirus in small mammals tends to be higher in degraded regions than in preserved regions, is true. It is necessary to have continuous monitoring, in small mammals and also in other wild animals, in order to have effective viral control and also to anticipate the emergence of new viruses of zoonotic origin.

Os mamíferos executam papéis fundamentais nas dinâmicas dos ecossistemas, protagonizando diferentes serviços ecossistêmicos. Dentre os mamíferos das florestas de regiões neotropicais, os pequenos mamíferos formam um dos grupos ecológicos mais diversificados. A estrutura da paisagem reflete no deslocamento de indivíduos, alterando a densidade de diferentes populações de animais, influenciando na taxa de transmissão de patógenos entre estes animais, e também entre humanos. Os pequenos mamíferos são potenciais hospedeiros e/ou reservatórios de vírus que podem ocasionar doenças zoonóticas. Dentre as zoonoses emergentes, em que o ciclo de transmissão está relacionado a esses animais, as hantaviroses são uma das mais importantes. Dados da literatura sugerem que a taxa de detecção viral em animais silvestres tende a ser maior em áreas degradadas do que em áreas preservadas. Comparou-se dados coletados em uma área de região periurbana com a literatura científica de análises semelhantes. Foram realizadas duas campanhas de campo para a captura de pequenos mamíferos terrestres. Para a detecção de Hantavírus, foram coletadas e analisadas amostras de swabs orais e retais dos espécimes capturados, e também foram analisadas amostras de swabs coletados anteriormente em quirópteros no mesmo local em 2021. Das 86 amostras de pequenos mamíferos analisadas por qPCR e por PCR convencional, todas foram negativas para Hantavírus. A não detecção de Hantavírus nos pequenos mamíferos amostrados no local de estudo não exclui a possibilidade de presença deste vírus nesses animais na área amostrada e também na região em que essa área se encontra, visto que este vírus já foi encontrado em regiões próximas. Não foi possível averiguar se a hipótese, de que a incidência de Hantavírus em pequenos mamíferos tende a ser maior em regiões degradadas do que em regiões preservadas, é verdadeira. É necessário que haja um monitoramento contínuo, em pequenos mamíferos e também em outros animais silvestres, para que se tenha um controle viral eficaz e também para antecipar o surgimento de novos vírus de origem zoonótica.

Morcellement du corps et chirurgie bariatrique. De l'organique au corporel dans leur rapport aux logiques structrurelles / Body fragmentation and bariatric surgery. From the organic to the corporeal in their relationship to structural logics / Fragmentação do corpo e cirurgia bariátrica. Do orgânico ao corpóreo em sua relação com a lógica estrutural / Fragmentación corporal y cirurgía bariátrica. De lo orgánico a lo corpóreo en su relación con las lógicas estructurales

Les auteurs, cliniciens et chercheurs en psychopathologie, développent un phénomène psychique transtructurel rencontré chez des patients obèses opérés d'une chirurgie bariatrique: des fantasmes et des délires de morcellement corporel. C'est à partir d'un cas clinique de névrose et un autre de psychose, que l'impact psychique de la chirurgie bariatrique sera étudié, avec la mise en lumière d'une altération de l'image du corps et de ses sensations qui serait à l'origine de ce phénomène de morcellement.

The authors, clinicians, and researchers in psychopathology, developed a trans-structural psychic phenomenon found in obese patients who have undergone bariatric surgery: fantasies and delusions of body fragmentation. The psychic impact of bariatric surgery was studied based on a clinical case of neurosis and another one of psychosis, highlighting an alteration of body image and its sensations which would be at the origin of this phenomenon of fragmentation.

Resumos Os autores, clínicos e pesquisadores em psicopatologia, desenvolvem um fenômeno psíquico transestrutural encontrado em pacientes obesos submetidos à cirurgia bariátrica: fantasias e delírios de fragmentação do corpo. Com base em um caso clínico de neurose e outro de psicose, será estudado o impacto psíquico da cirurgia bariátrica, destacando uma alteração na imagem do corpo e suas sensações, que estariam na origem desse fenômeno de fragmentação.

Los autores, clínicos e investigadores en el campo de la psicopatología, desarrollan un fenómeno psíquico transestructural encontrado en pacientes obesos sometidos a la cirugía bariátrica: fantasías y delirios de fragmentación del cuerpo. Desde un caso clínico de neurosis y otro de psicosis, se estudiará el impacto psíquico de la cirugía bariátrica, destacando una alteración de la imagen corporal y de sus sensaciones, que serían el origen de este fenómeno de fragmentación.

Seed bank analysis and species similarity in the Guarnição da Aeronáutica de Pirassununga (São Paulo State, Brazil) / Análise do banco de sementes e similaridade de espécies na Guarnição da Aeronáutica de Pirassununga (Estado de São Paulo, Brasil)

Riparian forests suffered from forest fragmentation, which in turn promote the change in the pattern of seed dispersion and modification of soil seed bank.  The aim of this study is to indicate the main species that make up the seed bank of a stretch of riparian forest of the Mogi Guaçu River continued to a fragment of semidecidual forest, located in the Guarnição da Aeronáutica de Pirassununga. It was delimited ten plots of 10 x 10 m. Four soil samples was collected by plot with a 25 x 25 cm template. Samples were packed in greenhouse for seed germination and monitored every 15 days for six months. Altogether, 494 individuals from 19 families were sampled, distributed in 30 genera and 40 morphospecies. Diversity and distribution of species in the fragment is homogeneous and can be used as source of propagules for forest restoration.

Florestas ripárias sofrem com a fragmentação florestal, que promove mudanças no padrão de dispersão de sementes e modificação do banco de sementes. O objetivo do presente estudo é indicar as principais espécies que compõem o banco de semntes de um trecho de floresta ripária do Rio Mogi Guaçu River contínuo a um fragmento de floresta estacional, localizada na Guarnição da Aeronáutica de Pirassununga. Foram delimitadas dez parcelas de 10 x 10 m. Quatro amostras de solo foram coletadas através de um molde de 25 x 25 cm. Amostras foram mantidas em estufa para germinação de sementes e monitoradas a cada 15 dias por seis meses. Ao todo, 494 indivíduos pertencentes a 19 famílias foram amostrados, distribuídos em 30 gêneros e 40 morfoespécies. A diversidade e a distribuição das espécies no fragmento é homogênea, podendo ser usado como uma fonte de propágulos para restauração florestal.

Sistemas de informação na gestão de recursos humanos em saúde da Secretaria de Estado de Saúde do Rio de Janeiro / Information systems in the administration of human resources in health at the Rio de Janeiro State Department of Health

Este estudo aborda o tema de sistemas de informação utilizados na gestão de recursos humanos em saúde na Secretaria de Estado de Saúde do Rio de Janeiro (SES/RJ), órgão da Administração Direta do Poder Executivo do Estado. A SES/RJ é responsável por definir políticas de saúde no Estado, a qual utiliza vários sistemas de informação para gestão de sua força de trabalho, com evidências de fragmentação dos dados, dificuldade na gestão das informações e prejuízo na definição de estratégias. Nesse sentido, este trabalho tem como objetivo descrever os sistemas de informação de recursos humanos em uso na SES/RJ, no contexto dos modelos de gestão adotados em suas unidades de saúde, e contribuir para melhorar a gestão de recursos humanos e das informações geradas no âmbito da instituição, fornecendo subsídios para o processo de tomada de decisão. Para tanto, fez-se, primeiramente, uma revisão bibliográfica sobre o tema desde o ano de 1995, período da Reforma do Estado, e uma pesquisa documental em portais e legislações, tanto da SES/RJ como de outros órgãos estaduais, assim como das esferas federal e municipal. Em seguida, o trabalho discute as possibilidades e os subsídios que possam favorecer a interoperabilidade desses sistemas e, assim, facilitar a gestão da força de trabalho na instituição.

This study investigates the use of information systems in the administration of human resources in health at the Rio de Janeiro State Department of Health (SES/RJ), which is part of the Direct Administration of the State Government. SES/RJ oversees establishing state health policies and managing its staff using a variety of information systems, with evidence of data fragmentation, information management challenges, and strategy development impairment. In this sense, this study aims to describe the human resources information systems in use at SES/RJ in relation to the management models used in its health units, as well as to contribute to improving human resources management and the information generated within the institution by providing decision-making inputs. To that end, we conducted a bibliographic review of the topic dating back to 1995, during the State Reform period, as well as document search in the portals and legislation of SES/RJ and other state agencies, as well as federal and municipal domains. The study then moves on to the possibilities and advantages that may encourage system interoperability and, as a result, make labor management in the institution easier.

Use of melatonin as an inhibitor of apoptotic process for cryopreservation of zebrafish (Danio rerio) embryos / Uso da melatonina como inibidor do processo apoptotico para a criopreservação de embriões de zebrafish (Danio rerio)

This study investigated the use of melatonin to arrest the effects of apoptosis in vitrified zebrafish (D. rerio) embryos. Dechorionated embryos at 22-24 somite-stage were divided (n = 60/treatment) into a non-vitrified (Control Group, 0 M melatonin) and vitrified treatments with 0 M (T1), 1 µM (T2) and 1 mM of melatonin (T3). For vitrified treatments, a solution methanol/propylene glycol based was used and the embryos stored in -196 °C for a week. After thaw, survival rate, scanning electron microscopy, expression of anti (bcl-2) and pro-apoptotic (bax/caspase-3) genes, reactive oxygen species (ROS) formation and DNA fragmentation analyses were performed. No live embryos were obtained from vitrified treatments, observing a rapid degeneration immediately after thawing, with the vitelline layer rupture and leakage of its content, followed by breakdown of epithelial cells and melanisation of the tissue. Regarding the apoptotic process, T3 had the highest relative gene expression, for the three genes (P 0.05). The inclusion of 1 µM of melatonin in the vitrifying solution, countered the effects of apoptotic process in post-thaw embryos, suggesting its utility in cryopreserving fish embryos.

Este estudo investigou o uso da melatonina para conter os efeitos da apoptose em embriões vitrificados de zebrafish (D. rerio). Embriões descorionados no estágio de 22-24 somitos foram divididos (n = 60 / tratamento) em tratamento não vitrificado (Grupo Controle, melatonina 0 M) e tratamentos vitrificados com 0 M (T1), 1 µM (T2) e 1 mM de melatonina (T3). Para os tratamentos vitrificados, utilizou-se uma solução à base de metanol/propilenoglicol e os embriões foram armazenados em -196 °C por uma semana. Após o descongelamento, foram realizadas análises de taxa de sobrevivência, microscopia eletrônica de varredura, expressão dos genes anti (bcl-2) e pró-apoptóticos (bax/caspase-3), formação de espécies reativas de oxigênio (EROS) e análises de fragmentação de DNA. Não foram obtidos embriões vivos a partir dos tratamentos vitrificados, observando uma rápida degeneração imediatamente após o descongelamento, com ruptura da camada vitelina e vazamento de seu conteúdo, seguida de quebra das células epiteliais e melanização do tecido. Em relação ao processo apoptótico. T3 apresentou expressão gênica relativa alta para os três genes (P 0,05). A inclusão de 1 µM de melatonina na solução de vitrificação, contrariou os efeitos do processo apoptótico em embriões pós-descongelamento, sugerindo sua utilidade na criopreservação de embriões de peixes.

Use of melatonin as an inhibitor of apoptotic process for cryopreservation of zebrafish (Danio rerio) embryos

Abstract This study investigated the use of melatonin to arrest the effects of apoptosis in vitrified zebrafish (D. rerio) embryos. Dechorionated embryos at 22-24 somite-stage were divided (n = 60/treatment) into a non-vitrified (Control Group, 0 M melatonin) and vitrified treatments with 0 M (T1), 1 µM (T2) and 1 mM of melatonin (T3). For vitrified treatments, a solution methanol/propylene glycol based was used and the embryos stored in -196 °C for a week. After thaw, survival rate, scanning electron microscopy, expression of anti (bcl-2) and pro-apoptotic (bax/caspase-3) genes, reactive oxygen species (ROS) formation and DNA fragmentation analyses were performed. No live embryos were obtained from vitrified treatments, observing a rapid degeneration immediately after thawing, with the vitelline layer rupture and leakage of its content, followed by breakdown of epithelial cells and melanisation of the tissue. Regarding the apoptotic process, T3 had the highest relative gene expression, for the three genes (P 0.05) furthermore, T2 had similar expression of pro-apoptotic genes to CG (P 0.05). ROS formation revealed that CG presented lower percentage of embryo surface area affected (3.80 ± 0.40%) (P 0.05), in contrast, no differences were found among the other groups. T1 was most significantly (P 0.05) damaged by DNA fragmentation. The vitrified groups with melatonin had similar damage levels of CG (P > 0.05). The inclusion of 1 µM of melatonin in the vitrifying solution, countered the effects of apoptotic process in post-thaw embryos, suggesting its utility in cryopreserving fish embryos.

Resumo Este estudo investigou o uso da melatonina para conter os efeitos da apoptose em embriões vitrificados de zebrafish (D. rerio). Embriões descorionados no estágio de 22-24 somitos foram divididos (n = 60 / tratamento) em tratamento não vitrificado (Grupo Controle, melatonina 0 M) e tratamentos vitrificados com 0 M (T1), 1 µM (T2) e 1 mM de melatonina (T3). Para os tratamentos vitrificados, utilizou-se uma solução à base de metanol/propilenoglicol e os embriões foram armazenados em -196 °C por uma semana. Após o descongelamento, foram realizadas análises de taxa de sobrevivência, microscopia eletrônica de varredura, expressão dos genes anti (bcl-2) e pró-apoptóticos (bax/caspase-3), formação de espécies reativas de oxigênio (EROS) e análises de fragmentação de DNA. Não foram obtidos embriões vivos a partir dos tratamentos vitrificados, observando uma rápida degeneração imediatamente após o descongelamento, com ruptura da camada vitelina e vazamento de seu conteúdo, seguida de quebra das células epiteliais e melanização do tecido. Em relação ao processo apoptótico. T3 apresentou expressão gênica relativa alta para os três genes (P 0,05), além disso, T2 apresentou expressão semelhante as dos genes pró-apoptóticos de GC (P 0,05). A formação de EROS revelou que GC apresentou menor percentual de área de superfície embrionária afetada (3,80 ± 0,40%) (P 0,05), ao contrário, não foram encontradas diferenças entre os outros grupos. T1 foi mais significativamente (P 0,05) danificado pela fragmentação do DNA. Os grupos vitrificados com melatonina apresentaram níveis de dano semelhantes ao do GC (P> 0,05). A inclusão de 1 µM de melatonina na solução de vitrificação, contrariou os efeitos do processo apoptótico em embriões pós-descongelamento, sugerindo sua utilidade na criopreservação de embriões de peixes.

Use of melatonin as an inhibitor of apoptotic process for cryopreservation of zebrafish (Danio rerio) embryos / Uso da melatonina como inibidor do processo apoptotico para a criopreservação de embriões de zebrafish (Danio rerio)

This study investigated the use of melatonin to arrest the effects of apoptosis in vitrified zebrafish (D. rerio) embryos. Dechorionated embryos at 22-24 somite-stage were divided (n = 60/treatment) into a non-vitrified (Control Group, 0 M melatonin) and vitrified treatments with 0 M (T1), 1 µM (T2) and 1 mM of melatonin (T3). For vitrified treatments, a solution methanol/propylene glycol based was used and the embryos stored in -196 °C for a week. After thaw, survival rate, scanning electron microscopy, expression of anti (bcl-2) and pro-apoptotic (bax/caspase-3) genes, reactive oxygen species (ROS) formation and DNA fragmentation analyses were performed. No live embryos were obtained from vitrified treatments, observing a rapid degeneration immediately after thawing, with the vitelline layer rupture and leakage of its content, followed by breakdown of epithelial cells and melanisation of the tissue. Regarding the apoptotic process, T3 had the highest relative gene expression, for the three genes (P < 0.05) furthermore, T2 had similar expression of pro-apoptotic genes to CG (P < 0.05). ROS formation revealed that CG presented lower percentage of embryo surface area affected (3.80 ± 0.40%) (P < 0.05), in contrast, no differences were found among the other groups. T1 was most significantly (P < 0.05) damaged by DNA fragmentation. The vitrified groups with melatonin had similar damage levels of CG (P > 0.05). The inclusion of 1 µM of melatonin in the vitrifying solution, countered the effects of apoptotic process in post-thaw embryos, suggesting its utility in cryopreserving fish embryos.

Este estudo investigou o uso da melatonina para conter os efeitos da apoptose em embriões vitrificados de zebrafish (D. rerio). Embriões descorionados no estágio de 22-24 somitos foram divididos (n = 60 / tratamento) em tratamento não vitrificado (Grupo Controle, melatonina 0 M) e tratamentos vitrificados com 0 M (T1), 1 µM (T2) e 1 mM de melatonina (T3). Para os tratamentos vitrificados, utilizou-se uma solução à base de metanol/propilenoglicol e os embriões foram armazenados em -196 °C por uma semana. Após o descongelamento, foram realizadas análises de taxa de sobrevivência, microscopia eletrônica de varredura, expressão dos genes anti (bcl-2) e pró-apoptóticos (bax/caspase-3), formação de espécies reativas de oxigênio (EROS) e análises de fragmentação de DNA. Não foram obtidos embriões vivos a partir dos tratamentos vitrificados, observando uma rápida degeneração imediatamente após o descongelamento, com ruptura da camada vitelina e vazamento de seu conteúdo, seguida de quebra das células epiteliais e melanização do tecido. Em relação ao processo apoptótico. T3 apresentou expressão gênica relativa alta para os três genes (P <0,05), além disso, T2 apresentou expressão semelhante as dos genes pró-apoptóticos de GC (P <0,05). A formação de EROS revelou que GC apresentou menor percentual de área de superfície embrionária afetada (3,80 ± 0,40%) (P <0,05), ao contrário, não foram encontradas diferenças entre os outros grupos. T1 foi mais significativamente (P <0,05) danificado pela fragmentação do DNA. Os grupos vitrificados com melatonina apresentaram níveis de dano semelhantes ao do GC (P> 0,05). A inclusão de 1 µM de melatonina na solução de vitrificação, contrariou os efeitos do processo apoptótico em embriões pós-descongelamento, sugerindo sua utilidade na criopreservação de embriões de peixes.

In pieces: fragmentation in the work of sándor ferenczi / Em pedaços: a fragmentação na obra de sándor ferenczi

RESUMO: Existem duas maneiras de se pensar a fragmentação subjetiva na obra de Ferenczi. Os fragmentos podem resultar de um choque ou podem estar relacionados a uma multiplicidade original da qual a própria subjetividade deriva. Neste artigo, levo em consideração as duas perspectivas nos textos ferenczianos, enfocando mais uma delas - o fragmento como irredutível à unidade. Trata-se de uma questão contemporânea, uma vez que as subjetividades e suas relações afetivas, estéticas e políticas funcionam hoje, predominantemente, sob forma fragmentária.

Abstract: There are two ways to conceive the idea of fragmentation in Ferenczi's work. They may result from a shock or they may be related to an original multiplicity from which subjectivity itself derives. In this paper I take into consideration the two perspectives of fragments in Ferenczian articles, but focusing more on one of them - the idea of fragment as irreducible to a unity. It is a contemporary issue, since subjectivities, and their affective, aesthetic and political relations work predominantly in fragmentary mode today.

Anthropogenic river fragmentation reduces long-term viability of the migratory fish Salminus brasiliensis (Characiformes: Bryconidae) populations

Life-history, geographical barriers, and damming can shape the genetic diversity of freshwater migratory fish, which are particularly vulnerable to anthropogenic impacts. We investigated the genetic diversity of Salminus brasiliensis, a long-distance migratory species that is recognized as an important provider of ecosystem services. We implemented microsatellite analyses to assess genetic diversity and simulate future scenarios for evaluating the long-term viability of dammed and non-dammed populations from the Uruguay River. High levels of genetic diversity were detected for all sampled populations. However, effective population sizes were lower in the uppermost river stretches, where the landscape is highly fragmented. Population structure analysis indicated two spatial genetic populations. It is suggested that this genetic structure preserves populations partially isolated by an ancient natural barrier, instead of being a result of the presence of dams. The simulated genetic scenarios indicated that genetic variability of S. brasiliensis populations from upstream dams could collapse over the years, mainly due to the reduction in the number of alleles. Therefore, besides helping to better understand issues related to the influence of dams on the genetic diversity of migratory fish, our results are especially relevant for driving local fishery policies and management actions for the species conservation.'

História de vida, barreiras geográficas e barramento dos rios podem moldar a diversidade genética de grandes peixes migratórios de água doce, que são particularmente vulneráveis a impactos antrópicos. Nós investigamos a diversidade genética de Salminus brasiliensis, uma espécie migratória de longa distância que é reconhecida como um importante provedor de serviços ecossistêmicos. Realizamos análises de microssatélites para avaliar a diversidade genética e simular cenários futuros, possibilitando estimar a viabilidade em longo prazo de populações situadas em regiões com e sem represas do rio Uruguai. Altos níveis de diversidade genética foram detectados para todas as populações amostradas. Contudo, os tamanhos populacionais efetivos foram menores nos trechos superiores do rio, onde a paisagem é altamente fragmentada. A análise da estrutura populacional indicou duas populações genéticas espaciais. Sugere-se que esta estrutura genética preserva populações parcialmente isoladas por uma antiga barreira natural, ao invés de ser resultado da presença de barragens. Os cenários genéticos simulados indicaram que a variabilidade genética das populações de S. brasiliensis situadas a montante das barragens entraria em colapso ao longo dos anos, principalmente como resultado da redução do número de alelos. Portanto, além de ajudar a entender melhor questões relacionadas à influência de barragens na diversidade genética de peixes migradores, nossos resultados são especialmente relevantes para a condução de políticas pesqueiras locais e ações de manejo para a conservação das espécies.(AU)

A cascade of dams affects fish spatial distributions and functional groups of local assemblages in a subtropical river

Dams reduce the longitudinal connectivity of rivers and thereby disrupt fish migration and the spatial distribution of species, impacts that remain poorly studied for some Neotropical rivers from mega-diverse basins. We investigated the spatial distribution of fish species with different trophic and movement/reproductive/size characteristics to assess how functional groups have responded to a cascade of dams on the Uruguai River in southern Brazil. Fish abundance, biomass, and species composition were evaluated at eight locations along the longitudinal gradient. The fish assemblage in the upper stretch was mainly characterized by small and medium-sized species at higher trophic levels, whereas the sites located furthest downstream displayed more medium and large-sized species, including many carnivorous species. Species with high fecundity, seasonal migrants, and catfishes with internal fertilization were common in the river´s middle and lower reaches. Detritivorous species dominated areas distant from the dams. Overall, functional diversity of local fish assemblages was greater in lower reaches. The cascade of dams has impacted the distribution of functional groups of local fish assemblages of Uruguai River. The alteration of functional groups in upper reaches of the river has potential consequences for ecosystem processes and services, such as nutrient cycling and fisheries.(AU)

As barragens reduzem a conectividade longitudinal dos rios e interrompem a migração e a distribuição espacial das espécies, configurando impactos pouco estudados para alguns rios Neotropicais megadiversos. Investigamos a distribuição espacial de espécies de peixes com diferentes características tróficas e reprodutivas para avaliar como grupos funcionais responderam a uma cascata de reservatórios no rio Uruguai, sul do Brasil. Abundância de peixes, biomassa e composição de espécies foram avaliadas em oito locais ao longo do gradiente longitudinal. A assembleia de peixes no trecho superior foi caracterizada principalmente por espécies de pequeno e médio porte em níveis tróficos mais elevados, enquanto que os ambientes localizados mais a jusante apresentaram mais espécies de médio e grande porte, incluindo muitas espécies carnívoras. Espécies com alta fecundidade, migradores sazonais e bagres com fertilização interna foram comuns no curso médio e inferior. Espécies detritívoras dominaram áreas distantes das barragens. A diversidade funcional das assembleias de peixes locais foi maior nas partes inferiores. A cascata de barragens impactou a distribuição dos grupos funcionais das assembleias de peixes locais no rio Uruguai. A alteração da diversidade funcional no curso superior do rio tem consequências potenciais para a dinâmica e serviços do ecossistema, como ciclagem de nutrientes e pesca.(AU)

Effect of cryoprotectant on the motility, viability, fertilization, and DNA integrity of naleh fish Barbonymus sp. (Cyprinidae) sperm / Efeito do crioprotetor na motilidade, viabilidade, fertilização e integridade do DNA no sêmen de peixes naleh Barbonymus sp. (Cyprinidae)

Naleh fish Barbonymus sp. is a commercial freshwater fish, which is indigenous to Aceh, Indonesia. The population of this species has declined over the years as a result of habitat perturbations and overfishing. Hence, the crucial need to develop a cryopreservation method to support breeding programs. This involved the use of a cryoprotectant as an important component. The objective of this study, therefore, was to explore the best cryoprotectant for naleh fish spermatozoa, and a total of five types were tested. These include the DMSO, Methanol, Ethanol, Glycerol, and Ethylene Glycol at a similar concentration of 10%, which were individually combined with 15% egg yolk, and every treatment was performed in three replications. Conversely, Ringer's solution was adopted as an extender, and the sperm was cryopreserved in liquid nitrogen for 15 days. The results showed significant influence on sperm motility and viability, as well as egg fertility of naleh fish (P <0.05), although the DMSO provided the best outcome, compared to others at 47.17%, 50.13%, and 45.67%, respectively. Furthermore, DNA fragmentation had not occurred in the fresh and cryopreserved sperm samples, indicating the protective effect of tested cryoprotectants. It is concluded that the 10% DMSO and 15% egg yolk is the best cryoprotectant for naleh fish spermatozoa.(AU)

O peixe naleh Barbonymus sp. é um peixe comercial de água doce, originário de Aceh, Indonésia. Durante vários anos, as perturbações provocadas no seu habitat e a pesca predatória determinaram o declínio da sua população, cuja preservação deve apoiar-se em um programa de reprodução controlada, com o emprego de espermatozoides criopreservados. O presente trabalho realizou um estudo comparativo de cinco crioprotetores: dimetilsultóxido, metanol, etanol, glicerol e etileno glicol. Todos os crioprotetores foram testados na concentração de 10%, combinados a 15% de gema de ovo. Cada tratamento foi efetuado em triplicatas. A solução de ringer foi utilizada como extensor e o esperma foi criopreservado em nitrogênio líquido por 15 dias. Os resultados obtidos revelaram a existência de influência significante (P<0,05) na viabilidade e motilidade espermática bem como na fertilidade dos ovos do peixe naleh, em que o dimetilsulfóxido apresentou o melhor resultado com os valores de 47,17%, 50,13% e 45,67%, respectivamente. Por outro lado, a fragmentação do DNA não ocorreu nas amostras de esperma fresco e criopreservado, indicando o efeito protetor dos crioprotetores testados. A conclusão obtida foi que o dimetilsulfóxido e 15% de gema de ovo foram o melhor crioprotetor para os espermatozoides do peixe naleh.(AU)

Rodent helminths in fragmented Atlantic Forest areas in the western region of the state of Paraná / Helmintos de roedores em áreas fragmentadas de Mata Atlântica na região Oeste do Estado do Paraná

Abstract Rodents are small mammals that can be parasitized by various helminths. This study aimed to identify and describe the ecological indicators of infection in rodents captured in fragments of the Atlantic Forest in the western region of Paraná State, Brazil. Sixty-eight specimens of five rodent species were collected, necropsied, and inspected in search of helminths. The parasites were stored in 70% ethanol, morphologically identified, and counted for calculation of infection indicators. Fourteen species of helminths and one species of Crustacea were recorded: ten in Akodon montensis, four in Mus musculus, two in Thaptomys nigrita, two in Oligoryzomys nigripes, and one in Euryoryzomys russatus. The registered species of parasites were: Rodentolepis akodontis, Angiostrongylus sp., Protospirura numidica criceticola, Trichuris navonae, Syphacia alata, Syphacia criceti, Syphacia evaginata, Trichofreitasia lenti, Stilestrongylus aculeata, Stilestrongylus eta, Stilestrongylus gracielae, Stilestrongylus franciscanus, Stilestrongylus moreli, Stilestrongylus sp., and Pentastomida gen. sp. A positive correlation between the intensity of infection of T. navonae and T. lenti was observed with the body condition index of the host A. montensis. For all species, this study represents a new register of locality, and for eight of them a new host.

Resumo Roedores são pequenos mamíferos que podem ser parasitados por uma diversidade de helmintos. Este estudo teve como objetivo identificar e descrever os indicadores ecológicos de infecção por helmintos, em roedores capturados em fragmentos de Mata Atlântica, na região Oeste do Estado do Paraná, Brasil. Sessenta e oito animais foram coletados, necropsiados e inspecionados em busca de helmintos. Os parasitas foram armazenados em etanol 70%, identificados morfologicamente e contados para o cálculo dos indicadores de infecção. Quatorze espécies de helmintos e uma espécie de crustáceo foram registradas: dez em Akodon montensis, quatro em Mus musculus, duas em Thaptomys nigrita, duas em Oligoryzomys nigripes e uma em Euryoryzomys russatus. As espécies de parasitas registradas foram: Rodentolepis akodontis, Angiostrongylus sp., Protospirura numidica criceticola, Trichuris navonae, Syphacia alata, Syphacia criceti, Syphacia evaginata, Trichofreitasia lenti, Stilestrongylus aculeata, Stilestrongylus eta, Stilestrongylus gracielae, Stilestrongylus franciscanus, Stilestrongylus moreli, Stilestrongylus sp., e Pentastomida gen. sp. Uma correlação positiva entre a intensidade parasitária de T. navonae e T. lenti foi observada com o índice de condição corporal do hospedeiro A. montensis. Para todas as espécies, este estudo representa um novo registro de localidade, e para oito delas um novo hospedeiro.

Assessment of heavy metals and its impact on DNA fragmentation in different fish species / Avaliação de metais pesados e seu impacto na fragmentação de DNA em diferentes espécies de peixe

Abstract This study was conducted to assess water pollution by examining DNA fragmentation in selected fish organs (kidney, liver, gills, and muscle tissue) from Wallago attu, Sperata sarwari, Vulgaris vulgaris, and Labeo rohita collected from a known polluted section of the Chenab River, Pakistan, and from a control site. The fish were caught using a gill net and were assigned to three different weight groups (W1, W2, and W3) to study the degree of variation in DNA fragmentation in relation to body weight. In fish from the polluted site, DNA fragmentation was higher in kidney, liver, gills, and muscles, compared to the control. No significant DNA fragmentation was observed in fish collected from the control site. Highly significant (P < 0.01) relationship between body weight and DNA fragmentation was found in the organs of fish procured at the contaminated site. DNA fragmentation in body organs was found to be affected by the concentrations of lead, copper, nickel, and cadmium in W. attu, S. sarwari, L. rohita, and V. vulgarus harvested from Chenab River. DNA fragmentation in different freshwater fish species is therefore a reliable biomarker of water pollution.

Resumo Este estudo foi conduzido para avaliar a poluição da água examinando a fragmentação do DNA em órgãos de peixes selecionados (rim, fígado, brânquias e tecido muscular) de Wallago attu, Sperata sarwari, Vulgaris vulgaris e Labeo rohita coletados de uma conhecida área poluída do rio Chenab, Paquistão e de um local de controle. Os peixes foram capturados usando uma rede branquial e foram divididos em três grupos de pesos diferentes (W1, W2 e W3) para estudar o grau de variação na fragmentação do DNA em relação ao peso corporal. Nos peixes do local poluído, a fragmentação do DNA foi maior nos rins, fígado, brânquias e músculos, em comparação ao controle. Não foi observada fragmentação significativa do DNA em peixes coletados no local de controle. Relação altamente significativa (P <0,01) entre o peso corporal e a fragmentação do DNA foi encontrada nos órgãos dos peixes adquiridos no local contaminado. Verificou-se que a fragmentação do DNA nos órgãos do corpo é afetada pelas concentrações de chumbo, cobre, níquel e cádmio em W. attu, S. sarwari, L. rohita e V. vulgarus colhidos no rio Chenab. A fragmentação do DNA em diferentes espécies de peixes de água doce é, portanto, um biomarcador confiável da poluição da água.

Dynamics of vegetation structure in a fragmented landscape in Minas Gerais, Brazil / Dinâmica da estrutura da vegetação em uma paisagem fragmentada em Minas Gerais, Brasil

Abstract Considering that area and edge effects are the most important factors that lead to landscape changes from the fragmentation of terrestrial communities, the present study aimed to analyze changes in the structure of vegetation classes of a fragmented landscape. The methodology employed was based on a model of patch dynamics for the years between 1979 and 2015. The analysis was performed with quantitative (area, shape and edge effect) and qualitative (low declivity of the terrain, fire resistance and tolerance to variation in light) variables of the classes of vegetation. Processes of retraction and expansion of the vegetation classes were identified, as well as the alteration of the structure of the fragments, which resulted in the intensification of the edge effect.

Resumo Considerando que os efeitos de área e os efeitos de borda são os mais importantes fatores que levam às alterações na paisagem através da fragmentação de comunidades terrestre, o presente estudo teve por objetivo analisar as mudanças em área e estrutura das classes de vegetação de uma paisagem fragmentada. Para tanto, a metodologia foi baseada no modelo de dinâmica de manchas entre os anos de 1979 e 2015 e a análise por meio de variáveis quantitativas (área, formato e efeito de borda) e qualitativas (baixa declividade do terreno, resistência ao fogo e tolerância à variação de luz) das classes de vegetação. O presente estudo identificou processos de retração e expansão das classes de vegetação e a alteração na estrutura dos fragmentos resultando na intensificação do efeito de borda.

Phytosociological contrast of ferns and lycophytes from forest fragments with different surroundings matrices in southern Brazil / Contraste fitossociológico de samambaias e licófitas de fragmentos florestais com diferentes matrizes de entorno no sul do Brasil

Abstract Forest edges typically exhibit higher luminosity and lower humidity than the forest interior, resulting in an abiotic gradient. However, the degree of abiotic difference can be affected from the type of the matrix, influencing the selection of species. We compared the floristic and phytosociological structure of understory communities of ferns and lycophytes of the edge and interior of three forest sites influenced by different types of surrounding matrices (natural field, Pinus plantation, and cultivation of crops). In the region of Araucaria Forest, in Rio Grande do Sul, Brazil, twelve 10 × 10 m plots were selected at the edge and interior of each site, totaling 72 plots and to evaluate the phytosociological contrast, using as a parameter coverage and species richness per plot to evaluate this contrast. We recorded a total of 38 species in the studied areas, distributed in 15 families. The results show that the edge effect acts at different intensities in the analyzed sites. In the site with unnatural matrix, the composition was more homogeneous both in the edges and in the interiors and presented lower richness, showing a more pronounced and deep impact. Already in the site with natural matrix surroundings, although the border also presents low richness, the interior was about 3x richer. Based on our results, we concluded that fern conservation efforts should focus on fragments of Araucaria Forest inserted in the natural field, because the conversion of natural field into Pinus planting and cultivation of crops decreases ferns species both in the edges and forest interiors of the studied fragments, besides altering the phytosociological structure leading the communities to simplification.

Resumo Bordas florestais tipicamente exibem maior luminosidade e menor umidade que o interior florestal, resultando em um gradiente abiótico. Entretanto, o grau de diferença abiótica pode ser afetado a partir do tipo da matriz, influenciando a seleção de espécies. Comparamos a composição florística e a estrutura fitossociológica das comunidades de samambaias e licófitas na borda e interior de três sítios influenciados por diferentes matrizes (campo natural, plantio de Pinus e cultivo de olerícolas). Na região de Floresta com Araucária no Rio Grande do Sul, Brasil, foram sorteadas doze parcelas de 10 × 10 m na borda e no interior de cada sítio, totalizando 72 parcelas para avaliar o contraste fitossociológico, utilizando como parâmetro cobertura e riqueza das espécies por parcela para avaliar esse contraste. Registramos um total de 38 espécies nas áreas estudadas, distribuídas em 15 famílias. Os resultados mostraram que o efeito de borda atua em intensidades distintas nos sítios analisados. Nos sítios com matriz antropizada, a composição foi mais homogênea tanto nas bordas, quanto nos interiores e apresentou menor riqueza, demonstrando impacto mais pronunciado e profundo. Já no sítio com matriz de entorno natural, apesar da borda também apresentar baixa riqueza, o interior foi cerca de 3x mais rico. Sugerimos que os esforços de conservação de samambaias e licófitas em fragmentos com araucária, devem se concentrar em sítios inseridos em campo natural, pois, a conversão destes em plantio de Pinus e cultivo de olerícolas, diminui a diversidade dessas plantas, tanto nas bordas quanto nos interiores da floresta, além de alterar a estrutura fitossociológica levando as comunidades à simplificação.

Movement and longitudinal distribution of a migratory fish ( Salminus brasiliensis) in a small reservoir in southern Brazil

We investigated whether the movement and distribution of the migratory fish, Salminus brasiliensis, were affected by a small reservoir. We also examined how movement and distribution were related to water temperature, flow, and rainfall. In December 2011 and January 2012, 24 individuals were captured downstream from the dam, tagged with radio transmitters and released in the reservoir (5.46 km² total area). After being released in the reservoir, 18 of the 24 tagged fish travelled upstream, taking an average of 16.6 days to leave the reservoir, with daily movements varying from < 5 km/day to > 24 km/day. However, only seven tagged specimens (29.16%) returned to the lower reservoir section, while the rest remained in the intermediate and upper reservoir sections. Longitudinal distributions and movements were positively related to both upstream flow into the reservoir and water temperature. We found evidence that S. brasiliensis can recognize the longitudinal gradient and is able to continue its upstream migration. On the other hand, the reservoir negatively affected downstream movements, possibly because disorientation prevented movement to the lower reservoir section. Based on these results, we suggest that the impact of small reservoirs on migratory fish species should be objectively addressed in environmental impact assessments and management programs.(AU)

Neste estudo investigamos se o movimento e distribuição do peixe migrador, Salminus brasiliensis, são afetados por um pequeno reservatório. Também avaliamos como movimento e distribuição se relacionam com a temperatura da água, fluxo e pluviosidade. Em dezembro de 2011 e janeiro 2012, 24 indivíduos foram capturados a jusante da barragem, marcados com radiotransmissores e liberados no reservatório (5,46 km²). Depois de soltos, 18 dos 24 peixes marcados se deslocaram para montante, levando em média 16,6 dias para ultrapassar o reservatório com movimentos diários variando de < 5km/dia a > 24km/dia. Entretanto, apenas sete (29,16%) dos peixes marcados retornaram para seção inferior do reservatório, a maior parte mantendo-se nas seções intermediárias e superiores do reservatório. Distribuição longitudinal e movimento dos peixes foram relacionados positivamente com o fluxo de montante dentro do reservatório e com a temperatura da água. Assim, encontramos evidências que S. brasiliensis pode reconhecer o gradiente longitudinal e continuar sua migração ascendente. Por outro lado, nossos resultados também indicam que o movimento para jusante foi afetado, possivelmente, devido à desorientação, o que impede que os indivíduos alcancem as seções inferiores do reservatório. Com base nos resultados, sugerimos que impactos sobre peixes migratórios devem ser objetivamente abordados em avaliações ambientais e gestão ambiental de pequenos reservatórios.(AU)

Medium and large mammals in a Cerrado fragment in Southeast Goiás, Brazil: inventory and immediate effects of habitat reduction on species richness and composition / Mamíferos de médio e grande porte em um fragmento de Cerrado, no sudeste de Goiás, Brasil: inventário e efeitos imediatos da redução de habitat na riqueza e composição de espécies

Abstract: The reduction and fragmentation of remnant vegetation habitats has been one of the main threats to Cerrado biodiversity. The aim of the present study is to make an inventory of medium and large mammal species in a Cerrado remnant and to assess deforestation influence on part of this fragment on the richness and composition of mammal species. The study was conducted in a Cerrado fragment in southeast Goias State, Ipameri County. Data were collected during three different periods (P1, January-June, 2014; P2, December, 2016 - June, 2017; P3, July-December, 2017) through direct (visual, vocal and camera-trap records) and indirect methods (foot prints, animal burrows and other traces) in order to register the mammal species. Jackknife 1 estimator was used to estimate species richness during each of the three sampled periods and for the complete collection period; species similarity between periods was assessed through the Jaccard's Index of Similarity (Cj). Species richness between periods was performed through inference by overlapping confidence intervals (CI). Twenty-nine species were recorded during the assessed period, five of them were listed as endangered in Brazil. There was no significant change in species richness between the assessed periods: species richness of 25 species was observed in Period 1 (P1), the richness of 32 species was estimated (CI = 4.58); 23 species were recorded in Period 2 (P2), and the richness of 30 species was estimated (CI = 4.39), the richness of 23 species was observed in Period 3 (P3) and the richness of 28 species was estimated (CI = 4.70). Similarity in species composition between the assessed periods recorded Cj = 0.71 (71%) between P1 and P2, Cj = 0.66 (66%) between P1 and P3, and Cj = 0.77 between P2 and P3. Fragment deforestation did not influence the richness and composition of medium and large mammal species (within a period of 2~3 years) when the three periods were compared; however, the absence of changes in the community can be the result of time-lag, therefore, we cannot put aside the likelihood of mid and long-term effects.

Resumo: A fragmentação e a redução de hábitat de vegetação remanescente tem sido as principais ameaças à biodiversidade do Cerrado. Este trabalho teve como objetivo inventariar as espécies de mamíferos de médio e grande porte em um fragmento de Cerrado e avaliar a influência do desmatamento de parte desse fragmento na riqueza e composição de espécies de mamíferos. O estudo foi conduzido em um fragmento de Cerrado, no sudeste do Estado de Goiás, município de Ipameri. Os dados foram coletados em três períodos (P1 - janeiro-junho/2014, P2 - dezembro/2016-junho/2017 e P3 - julho-dezembro/2017) utilizando métodos diretos (visual, vocal e registros fotográficos) e indiretos (pegadas, tocas e outros sinais) para o registro das espécies de mamíferos. Foi estimada a riqueza de espécies para os três períodos amostrados e para todo período utilizando o estimador Jackknife 1 e a semelhança de espécies entre os períodos, pelo Índice de Similaridade de Jaccard (Cj). A comparação da riqueza de espécies estimada entre os períodos foi realizada pela inferência por sobreposição dos intervalos de confiança (IC). Em todo o período estudado foram registradas 29 espécies, sendo 5 destas listadas como ameaçadas de extinção no Brasil. Entre os períodos amostrados não foi observada mudança significativa na riqueza de espécies, sendo que no período 1 (P1) foi observada a riqueza de 25 espécies e estimada de 32 (IC = 4,58), no período 2 (P2) registrou-se 23 espécies e estimou-se 30 (IC = 4,39) e no período 3 (P3) a riqueza observada foi de 23 espécies e estimada 28 (IC = 4,70). A similaridade na composição de espécies entre os períodos foi de Cj = 0,71 (71%) entre P1 e P2, Cj = 0,66 (66%) entre P1 e P3 e Cj = 0,77 entre P2 e P3. Não foi observada influência do desmatamento do fragmento (no período de 2 a 3 anos) na riqueza e composição de espécies de mamíferos de médio e grande porte, comparando os três períodos amostrados. Contudo, a ausência de alterações na comunidade pode ser decorrente de um time-lag, não podendo descartar possíveis efeitos a médio e longo prazo.